株式譲渡所得の税率は、所得税（国税）７％、住民税（地方税）３％です。したがって、＞ところが、1月ころに証券会社から送られてきた取引明細には、「源泉徴収税額35万円」とだけ＞記載されています。＞欄外に小さく、「住民税特別徴収税額15万円」とのみ記載されています。は、正しいです。＞この場合、50万円の還付を受けるにはどうしたらいいのでしょうか？税務署の確定申告書は住民税の申告書も兼ねてます。申告書第一表、第二表、第三表の2ページ目の右上の欄外に(住)の文字があるでしょう。この用紙が自治体の税務課に回るようになってます。＞所得税の確定申告で住民税分も含めて還付申請できますか？はい、出来ます。上に書いたとおりです。還付額については、↓の回答にもありますように、所得割りはゼロですが、均等割りが発生します。したがって、全額は還付されません。