口座の種類により異なります。特定口座で源泉徴収ありの場合は遡って譲渡益の確定申告はできません。１）２年前とは平成１７年でしょうか？この損失は昨年確定申告をしていなければなりません。２）平成１８年に利益があった場合、今年３月１５日までに確定申告すると、平成１７年の損失と相殺され、譲渡税は０となり、損失が１００万円残った状態になります。ここでもし、平成１８年分の確定申告をしたとすると、１００万円所得があったとみなされ、基礎控除３８万円を引いた額を基に国民健康保険の保険料が計算されます。国民年金も同様で、免除申請時の審査対象になります。特定口座で源泉徴収ありの場合、確定申告をしなければ、所得０となり、国民年金の免除対象になると思います。しかし、将来の年金は減ります。